Accelerarea serviciul de secvenţiere a ADN-ului

BGI, cel mai mare institut de genomică din lume, lansează un serviciu de tip cloud, bazat pe GPU-urile NVIDIA, care le va permite cercetătorilor din întrega lume să realizeze analize bioinformatice secvenţiale (NGS) accesibile.

“EasyGenomics”, noul serviciu BGI dezvoltat în Shenzhen, China, îmbină interfaţa intuitivă cu ultima generaţie de analize, aplicaţii şi instrumente secvenţiale oferite de BGI. Toate acestea sunt integrate în cea mai mare platformă de secvenţiere din industrie, pentru a furniza toate informaţiile necesare biologilor, bioinformaticienilor şi, nu în ultimul rând, medicilor care vor să realizeze şi să obţină  o analiză secvenţială automatizată a ADN-ului.

Serviciul “EasyGenomics” este dezvoltat pentru a beneficia de puterea de calcul a unităţilor de procesare vizuală NVIDIA (GPU), care îmbunătăţesc performanţa procedeului de analiză a volumului mare de date specific analizei ADN, reducând timpul de procesare de la câteva zile la doar câteva ore, în comparaţie cu sistemele bazate pe procesoarele clasice. Soluţia software dezvoltată de BGI revoluţioneză cercetarea genomică pentru oamenii de ştiinţă din întreaga lume, aducând ştiinţa cu un pas mai aproape de era medicinei personalizate şi accesibile.

“Acest serviciu permite accesul unui număr mare de cercetători la analize secvenţiale detaliate a ADN mai performante şi mai accesibile, cu scopul de a utiliza genomica la o scară mai mare, pentru diagnosticarea clinică, esenţială în cercetarea maladiilor complexe”, a declarat Dr. Lin Fang, vicepreşedinte, BGI. “Creșterea performanţelor datorită folosirii unităţilor de procesare vizuală NVIDIA (GPU) reduce considerabil timpul de realizare a analizelor secvenţiale, de la 5 zile la doar 5 ore. Suntem siguri că implementarea definitivă a soluţiei EasyGenomics în sistemul de tip cloud va revoluţiona cercetarea genomică”.

Serviciul de tip cloud EasyGenomics este alcătuit din sisteme hibride dezvoltate cu ajutorul GPU-urilor NVIDIA Tesla M2070 şi M2075, care permit o procesare accelerată a informaţiilor secvenţiale ale ADN-ului, spre deosebire de sistemele dotate doar cu procesoare clasice. BGI intenţioneză să actualizeze serviciul EasyGenomics cu câteva sute de GPU-uri NVIDIA Tesla, pentru a permite accesul unui număr şi mai mare de utilizatori.

“Acesta ar putea fi anul genomului în valoare de $1000, luând în considerare declinul rapid al costurilor de realizare a analizelor secvenţiale. În curând ne vom confrunta cu o avalanşă de informaţii din partea genomicii secvenţiale”, a declarat Sumit Gupta, senior director, Tesla business, NVIDIA.

. Citeste tot la pcworld.ro.